Раньше я думал что всё на свете известно и только я, горемыко нечего незнаю, потом оказалось, что в природе не всё изучено словосочетание где здесь

Если ты имеешь ввиду словосочетания Подлежащее + Сказуемое.То:

Я думал Главное слово "Я"управляет глаголом "думал" (и так с другими , скажу лишь какие дальше). Но это не пиши " Я думал".

Изучено не все. Главное слово - "Изучено", управляет словами "не все".

Оказалось в природе. Главное слово " Оказалось" управляет словом " в природе".

Вроде бы все