Почему неодинаково количество звуков языка и количество букв алфавита? может ли буква обозначать два звука? может ли один звук обозначаться двумя буквами? примеры.

Потому что много букв обозначаются не одним звуком. 
ё -йо, я-йа и т.д.
ль - (л), в общем все мягкие, например