Как указать и подчеркнуть корень в слове напёрсток и перчатки.

Наперсток -  корень Перст
Перчатки -корень перчат

Наперсток - от слова перст (палец на руке), наперсток надевается на руку - следовательно, это и есть корень :)
А в "перчатки", скорее всего, корень перчатк-;  перч- - корень исторический (или как-то там) :)