Нерациональное использование земель, вырубка лесов, загрязнение прибрежных вод, превращение некоторых островов в военные полигоны нарушили природное равновесие, привели к разрушению многих природных комплексов островов. Большой вред природе островов наносят туристы — любители подводной охоты и собиратели живых сувениров.
