Санкт-петербург расположен буквально на уровне моря, а москва -на высоте почти 300 м над уровнем моря.где при прочих равных условиях атмосферное давление должно быть больше, а где меньше?

Атмосферное давление будет в Питере будет больше, а в Москве, следовательно, меньше. На меньшей высоте над уровнем моря будет большее давление.
вот