В марте 1774 года восставшие потерпели ряд крупных поражений. В конце февраля — начале марта правительственные войска сожгли основную базу Белобородова на Среднем Урале — Шайтанский завод, и в конце марта восстание в этом районе оказалось в основном подавленным. После тяжелого поражения под Татищевой крепостью, потеряв множество людей, Пугачев был вынужден прекратить почти полугодовую осаду Оренбурга. В начале апреля 1774 г . с небольшим отрядом в 500 казаков предводитель восстания уходит на Урал.
Пугачев Е. оформил для себя государственный аппарат, названный Государственной военной коллегией. Это был и главный штаб, и высшая власть, включая судебную. Коллегия осуществляла связь между отдельными отрядами, снабжала оружием и провизией, наладила изготовление боеприпасов, самоуправление в казацкой среде, ведала назначением и снятием с должностей. Коллегия также играла решающую роль в пропаганде, которая, отметим, была налажена хорошо – манифесты и прочие «документы» шли в разные районы государства (Урал, Сибирь, Заволжье, Казахстан).
