Инфузория туфелька имеет постоянную форму тела, напоминающую туфельку с тупым передним и заостренным задним концами. Вся клетка инфузории туфельки покрыта тонкой и гибкой очень сложно устроенной оболочкой. На поверхности клетки продольными рядами расположено огромное количество ресничек, также на теле имеется углубление, на дне которого находится клеточный рот, который переходит в клеточную глотку. На дне глотки пища попадает в пищеварительную вакуоль, где и переваривается. При этом питательные вещества поступают в цитоплазму и используются протистом. Оставшиеся внутри пищеварительной вакуоли непереваренные остатки пищи выбрасываются наружу через особый участок в задней части тела — порошицу. У инфузории туфельки имеется два разных по строению и функциям ядра. Большое бобовидное ядро контролирует жизненные процессы в клетке. Малое ядро округлой формы регулирует процесс размножения.
