Клетки грибов имеют ядра, в клетках бактерий ядра отсутствуют. Грибы могут быть многоклеточными и одноклеточными, бактерии же являются исключительно одноклеточными организмами. Бактерии, имеющие размер от 0,5 до 5 мкм и их можно разглядеть лишь с помощью микроскопа. Грибы же имеют большие размеры. Грибы ведут недвижимый образ жизни, среди бактерий есть виды, способные к подвижности. Грибы являются гетеротрофами, бактерии могут быть как автотрофами, так и гетеротрофами
