Какие генетические патологии можно установить с микроскопа?

Смотря какой микроскоп. С помощью обычного микроскопа возможно установить различные изменения числа хромосом в клетке, такие как:
- полиплоидия - увеличение числа геномов в клетке;
-  анеуплоидия - изменение (возможно как уменьшение, так и увеличение) числа отдельных хромосом (а не всего генома) в клетке;
- гаплоидия - уменьшение числа геномов  в соматических клетках до одного;
- псевдополиплоидия - слияние нескольких хромосом или их дробление