Пищеварительная система начинается ротовым отверстием, ограниченным челюстями с одинаковыми, прочно прирастающими зубами. Зубы используются для захвата и удержания добычи. С их помощью дробятся наружные покровы добычи. Язык подвижный, к концу раздваивается. Желудок и кишечник имеют развитую мускулатуру, что способствует лучшему прохождению перевариваемой пищи. Имеется крупная печень с желчным пузырем и поджелудочная железа. Кишечник длиннее, чем у земноводных, особенно у растительноядных пресмыкающихся. Кишечник открывается в клоаку.
