Чем спора бактерий отличается от бактериальной клетки?

В первую очередь, они отличаются размерами.
Споры предназначены для размножения. Из споры прорастает новый организм. 
Споры бактерий служат для пережидания неблагоприятных условий. При их наступлении бактерия теряет воду и покрывается плотной оболочкой. В таком виде она и пережидает неблагоприятные условия. А размножаются бактерии делением.