Во первых, у папоротников, клеткой, из которой прорастает гаметофит, является спора, они всегда равные. Тогда как у голосеменных гаметофиты разнополые и образуются из мегаспор и микроспор. Во-вторых, у папоротников на заростке образуются и архегонии и атнеридии, когда у голосеменных они образуются на женских и мужских шишках соответственно. В-третьих, у папоротниов зигота образуется на заростке и прорастает во взрослое растение, тогда как у голосеменных зигота развивается в семя, которое содержит питательные вещества для зародыша и обеспечивает ему более надежную защиту для прорастания.
Во-вторых, у папоротников на заростке образуются и архегонии и атнеридии, когда у голосеменных они образуются на женских и мужских шишках соответственно.
В-третьих, у папоротниов зигота образуется на заростке и прорастает во взрослое растение, тогда как у голосеменных зигота развивается в семя, которое содержит питательные вещества для зародыша и обеспечивает ему более надежную защиту для прорастания.