Как в процессе обмена веществ осуществляется связь организма со средой?

На примере дыхания, вдыхается смесь обогащенная кислородом, а выдыхается смесь богатая углекислым газом.

За счет поступления в организм веществ из внешней среды, далее они уже преобразуются и выводятся - это и есть обмен веществ.