Тело этих животных покрыто разнообразными по форме роговыми чешуями, зернышками, щитками. У некоторых видов под ними располагаются костные пластинки. Тело чешуйчатых удлиненное, цилиндрической формы. У ящериц имеются передние, задние парные конечности и хвост, а змеи и амфисбены лишены конечностей.
