Не смотря на сложную структуру любой природной экосистемы, количество трофических уровней в них редко бывает 3-4? почему?

Потому что действует правило экологической пирамиды, 10%,  передача энергии уменьшается в 10 раз. 

1 продуценты (автотрофы -зеленые растения) 100% солнечной энергии

2. консумент 1 порядка (заяц) 10% энергии

3. консумент 2 порядка (лиса) 1%

энергии дальше практически нет, поэтому такие короткие цепи.