Назва «археї» походить від грецького слова «архаїос», що означає «давній». Чому така назва не дуже пасує цій групі прокаріотів з огляду на їхнє походження?

Микробиолог Карл Вёзе утверждает, что бактерии, первые эукариоты и археи не являются самыми древними организмами на планете Земля. Он обосновывал это тем, что это три разные линии эволюции, мало как связанные между собой. По его словам они имели более древнего предка, который дал начало всем этим трём линиям, а какого - пока определить не удалось. Поэтому название "археи" можно считать неуместным, так как археи - не самые древние организмы на Земле, но лишь теоретически, так как никаких подтверждений словам Вёзе нет.