Медленно сняв заплечный мешок, прислонив ружьё к стволу сосны и дав мне определённый знак.(почему после слово сосны не надо запятая? ) мы ждали, пока он остановится, и тихо начали отходить.(почему после слово ждали надо запятая? )

Потому что, после слова мешок закончиось первое предложение, а пошло второе. И как известно, что в простом предложение где стоит одиночный союз И запчятая не ставится.